За разлика от червата (където разнообразието е желателно), вагиналният микробиом е най-здрав, когато е доминиран от един-единствен род: Lactobacillus. Тази доминация създава кисела вагинална среда, предпазваща от бактериална вагиноза, гъбични инфекции и полово предавани инфекции.
