Celijakija je autoimuna bolest u kojoj konzumacija glutena pokreće imunološki napad na sluznicu tankog crijeva, oštećujući njenu sposobnost apsorpcije nutrijenata. Simptomi uključuju jaku nadutost, proljev, bolove u trbuhu, umor i nutrijentne deficijencije. Istraživanja pokazuju da osobe s celijakijom imaju specifičnu disbiozu mikrobioma te da ciljani probiotici mogu pomoći obnovi crijevne barijere uz strogu bezglutensku prehranu.