Enterotipovi su skupovi mikrobiomskih sastava identificiranih u velikim populacijskim studijama — u suštini tip ličnosti vašeg crijevnog mikrobioma. Različiti enterotipovi povezani su s različitim prehrambenim obrascima, metaboličkim profilima i zdravstvenim ishodima. Ne postoji jedan idealni mikrobiom: naše mikrobiomske zajednice odražavaju naše jedinstvene genetske pozadine, okoline i zdravstvene povijesti.