Janewayeva hipoteza temeljni je imunološki koncept: imunološki sustav je obučen prepoznati mikrobiijalne obrasce na bakterijama koje tijelo uči tolerirati ili napadati. Vaš crijevni mikrobiom igra ključnu ulogu u toj edukaciji. Izloženost mikrobima u ranom životu doslovno oblikuje koji imunološki odgovori se razvijaju, što je djelomično razlog zašto je primjena antibiotika u dojenačkoj dobi povezana sa značajno višim stopama alergija, astme i autoimunih bolesti.