Lactobacillus je najprepoznatljiviji probiotički rod — nalazi se u jogurtu, kefiru i fermentiranom povrću. Lactobacillus vrste proizvode mliječnu kiselinu koja snižava pH crijeva i stvara nepovoljno okruženje za patogene. Različiti sojevi imaju specifične kliničke primjene: L. rhamnosus GG za proljev povezan s antibioticima, L. crispatus za zdravlje vaginalnog mikrobioma, L. plantarum za podršku crijevnoj barijeri i simptomima IBS-a, a L. paracasei za imunološku funkciju.
