Mikrobiom je potpuni ekosustav mikroorganizama i njihovog genetičkog materijala koji živi na i u ljudskom tijelu. Crijevni mikrobiom sam sadrži oko 100 bilijuna bakterija iz do 1000 različitih vrsta. Te bakterije obavljaju tisuće esencijalnih funkcija: proizvode vitamine, razgrađuju prehrambena vlakna, reguliraju imunitet, proizvode neurotransmitere i štite od patogena. Mikrobiom se danas smatra virtualnim organom.
