Sluznica je zaštitni sloj sluzi koji oblaže crijeva — prva linija obrane crijeva. Vrčaste stanice proizvode taj sloj koji je dom specijaliziranoj mikrobnoj zajednici i djeluje kao komunikacijsko sučelje između crijevnih bakterija i imunoloških stanica. Debljina sluznice ovisi o zdravom mikrobiomu: bakterije poput Akkermansia muciniphila stimuliraju produkciju sluzi, dok disbioza i kronična upala stanjuju taj sloj što povećava ranjivost na infekcije i propusna crijeva.
