Normalna mikrobiota odnosi se na karakterističnu zajednicu mikroorganizama koji nastanjuju zdravo ljudsko tijelo — stečenu prvotno rođenjem i dojenjem, a kontinuirano oblikovanu prehranom, okolišem i načinom života. U zdravoj osobi ta je zajednica stabilna, raznovrsna i otporna. Porod carskim rezom, hranjenje formulom, rana primjena antibiotika i doživotna ultraprerađena prehrana mijenjaju tu polaznu točku na načine koji mogu imati dugotrajne zdravstvene posljedice.