Rūgštinis refliuksas – labiausiai pasaulyje ieškoma virškinimo problema – pasireiškia, kai skrandžio rūgštis teka atgal į stemplę, sukeldama deginimą krūtinėje ar rūgštų skonį. Dažnas refliuksas diagnozuojamas kaip GERD. Nesubalansuotas žarnyno mikrobiomas gali pabloginti simptomus. Probiotinės intervencijos vis dažniau tiriamos kaip papildomas GERD valdymo būdas.