Celiakija yra autoimuninė būklė, kai glitimo vartojimas sukelia imuninį ataką prieš plonosios žarnos gleivinę, pažeisdamas jos gebėjimą absorbuoti maistines medžiagas. Simptomai apima stiprų pilvo pūtimą, viduriavimą, pilvo skausmus, nuovargį ir maistinių medžiagų trūkumą. Tyrimai rodo, kad asmenys su celiakija turi specifinį mikrobiomo disbiotą ir tiksliniai probiotikai gali padėti atkurti žarnyno barjero funkciją kartu su griežta be glitimo dieta.