Citokinai yra imuninės sistemos cheminiai pasiuntiniai – maži baltymai, kuriuos ląstelės naudoja bendravimui infekcijos ar uždegimo metu. Žarnyno mikrobiomas atlieka svarbų vaidmenį kalibruojant citokinų gamybą: subalansuotas mikrobiomas skatina priešuždegiminę signalizaciją, o disbiotas gali sukelti lėtinį žemos laipsnio uždegimą. Padidėję citokinai yra DŽS, ŽLL ir daugelio autoimuninių ligų požymis.
