Žarnyno dujos, gaminamos bakterinės fermentacijos metu iš nesuvirškintų angliavandenių, yra visiškai normalios nedideliais kiekiais. Perteklinės dujos, pilvo pūtimas ir meteorizmas signalizuoja, kad fermentacija vyksta per greitai, netinkamoje vietoje (kaip SIBO atveju) ar netinkamų bakterijų. Dujų gaminančios bakterijos linkusios dominuoti disbioso metu, o įvairus subalansuotas mikrobiomas gamina dujas palaipsniui. Probiotikai gali žymiai sumažinti perteklinę dujų gamybą.