Žarnyno flora yra plačiai vartojamas terminas mikroorganizmų bendrijai, gyvenančiai virškinimo sistemoje. Moksliniuose šaltiniuose pirmenybė teikiama terminui žarnyno mikrobiota. Sveiką žarnyno florą apibūdina didelė įvairovė, naudingų rūšių dominavimas ir gebėjimas atsigauti po sutrikimo. Žarnyno flora formuojama mitybos, gimimo būdo, antibiotikų istorijos, amžiaus ir gyvenimo būdo.
