Janeway hipotezė yra fundamentalus imunologijos konceptas: imuninė sistema yra išmokyta atpažinti mikrobinius šablonus ant bakterijų, kurias organizmas išmoksta toleruoti arba pulti. Jūsų žarnyno mikrobiomas atlieka centrinį vaidmenį šiame ugdyme. Ankstyvas mikrobinis poveikis tiesiogine prasme formuoja, kokie imuniniai atsakai vystosi – tai iš dalies paaiškina, kodėl antibiotikų vartojimas kūdikystėje siejamas su aukštesniais alergijų, astmos ir autoimuninių ligų rodikliais.