Tam tikros žarnyno bakterijos – ypač Akkermansia muciniphila ir Faecalibacterium prausnitzii – vadinamos raktinėmis rūšimis: nepaisant santykinai nedidelio skaičiaus, jos atlieka neproporcingai didelį vaidmenį mikrobiomo stabilumui ir žarnyno sveikatai. Jų netekimas gali sukelti kaskadines pusiausvyros sutrikimus mikrobinėje bendrijoje. Mažos F. prausnitzii koncentracijos nuolat randamos ŽLL ir DŽS pacientams.
