Patobiontai yra mikroorganizmai, kurie nekenksmingi subalansuotame mikrobiomuose, tačiau tampa žalingi pasikeitus sąlygoms. H. pylori, Clostridioides difficile ir tam tikros E. coli padermės egzistuoja nedideliu kiekiu daugelio sveiką žarnyną turinčių žmonių, nesukeldamos problemų. Disbiotas dėl antibiotikų, ligos ar mitybos pokyčių gali leisti patobiontams greitai peraugti ir sukelti tokias būkles kaip C. difficile kolitas, SIBO ir DŽS.