Skirtingai nuo žarnyno (kur įvairovė yra pageidautina), makšties mikrobiomas yra sveikiausias, kai dominuoja viena gentis: Lactobacillus. Ši dominacija sukuria rūgštinę makšties aplinką, apsaugančią nuo bakterinės vaginozės, mielių infekcijų, lytiškai plintančių infekcijų ir nėštumo komplikacijų, įskaitant priešlaikinį gimdymą. Makšties Lactobacillus populiacijų palaikymas tiksliniais oraliniais probiotikais yra įrodymais pagrįsta strategija su tvirtu klinikiniu pagrįstumu.
