Citokini so kemijski glasniki imunskega sistema — majhni proteini, ki jih celice uporabljajo za komunikacijo med okužbo ali vnetjem. Črevesni mikrobiom igra ključno vlogo pri umerjanju produkcije citokinov: uravnoteženi mikrobiom spodbuja protivnetno signalizacijo, medtem ko disbioza lahko sproži kronično nizko vnetje. Povišeni citokini so značilnost IBS-a, IBD-a in mnogih avtoimunskih stanj.
