Enterotipi so skupki sestav mikrobioma, identificirani v velikih populacijskih študijah — v bistvu tip osebnosti vašega črevesnega mikrobioma. Različni enterotipi so povezani z različnimi prehranskimi vzorci, metaboličnimi profili in zdravstvenimi izidi. Ne obstaja en idealni mikrobiom: naše mikrobne skupnosti odražajo naše edinstvene genetske ozadje, okolja in zdravstvene zgodovine.