Prehrambena intoleranca je neimunski prebavni odziv na določena živila ali njihove sestavine — različna od alergije na hrano, ki vključuje imunski sistem. Pogoste intolerancе vključujejo intoleranco za laktozo, intoleranco za histamin, malapsorpcijo fruktoze in občutljivost na gluten. Zdrav in raznolik mikrobiom pomaga pri prebavi in zmanjšuje verjetnost razvoja intolerancin, medtem ko disbioza lahko poslabša ali celo sproži intolerancе.
