Intoleranca za histamin je stanje, pri katerem telo ne more dovolj hitro razgraditi histamina — bodisi ker je encim DAO pomanjkljiv, črevesne bakterije prekomerno proizvajajo histamin ali oboje. Simptomi vključujejo glavobole, rdečenje kože in koprivnico, trebušne krče in napenjanje, drisko, zamašen nos in utrujenost po uživanju živil, ki sprožijo histamin. HIT je pogosto napačno diagnosticiran kot IBS ali alergije. Obnova ravnovesja črevesnega mikrobioma s ciljanimi probiotiki je najneposrednejša intervencija.