Janewayeva hipoteza je temeljni imunološki koncept: imunski sistem je naučen prepoznavati mikrobne vzorce na bakterijah, ki se jih telo nauči tolerirati ali napadati. Vaš črevesni mikrobiom igra osrednjo vlogo pri tej izobrazbi. Izpostavljenost mikrobom v zgodnjem življenju dobesedno oblikuje, kateri imunski odzivi se razvijejo, kar je delno razlog, zakaj je jemanje antibiotikov v dojenčaštvu povezano z bistveno višjo stopnjo alergij, astme in avtoimunskih bolezni v kasnejšem življenju.