Mikrobiom je popolni ekosistem mikroorganizmov in njihovega genetskega materiala, ki živi na in v človeškem telesu. Črevesni mikrobiom sam vsebuje približno 100 bilijonov bakterij iz do 1000 različnih vrst. Te bakterije opravljajo tisoč bistvenih funkcij: proizvajajo vitamine, razgrajujejo prehranska vlakna, uravnavajo imunost, proizvajajo nevrotransmiterje in ščitijo pred patogeni. Mikrobiom je zdaj štet za virtualni organ.
