Sluznica je zaščitna plast sluzi, ki oblaže črevesje — prva obrambna linija črevesja. Vrčaste celice proizvajajo to plast, ki je dom specializirani mikrobni skupnosti in deluje kot komunikacijski vmesnik med črevesnimi bakterijami in imunskimi celicami. Debelina sluznice je odvisna od zdravega mikrobioma: bakterije, kot je Akkermansia muciniphila, spodbujajo produkcijo sluzi, medtem ko disbioza in kronično vnetje tanjšata to plast in povečujeta ranljivost za okužbe in prepustno črevesje.