Normalna mikrobiota se nanaša na značilno skupnost mikroorganizmov, ki nastanjuje zdravo človeško telo — prvotno pridobljeno ob rojstvu in dojenjem ter nenehno oblikovano s prehrano, okoljem in načinom življenja. Pri zdravi osebi je ta skupnost stabilna, raznovrstna in odporna. Porod s carskim rezom, hranjenje s formulo, zgodnja uporaba antibiotikov in vseživljenjska ultra-predelana prehrana spremenijo to izhodišče na načine, ki imajo lahko trajne zdravstvene posledice.
