Kratkoverižne maščobne kisline — predvsem butirat, acetat in propionat — so najpomembnejši metaboliti, ki jih črevesne bakterije proizvajajo s fermentacijo prehranskih vlaken. Sluzijo kot primarni vir energije za celice debelega črevesa, uravnavajo imunsko delovanje, vzdržujejo integriteto črevesne bariere in celo vplivajo na delovanje možganov prek osi črevesje-možgani. Nizka produkcija SCFA je neposredno povezana z IBS-om, IBD-om, zaprtjem, prepustnim črevesom in metaboličnimi boleznimi.
