Ksenobiotiki so tuje kemične snovi — zdravila, pesticidi, prehrambeni aditivi in onesnaževalci okolja — ki lahko bistveno spremenijo črevesni mikrobiom. Inhibitorji protonske črpalke bistveno zmanjšajo raznolikost mikrobioma. Umetna sladila so pokazala, da spremenijo uravnavanje krvnega sladkorja prek sprememb mikrobioma. Zavedanje o ksenobiotikob je podcenjena razsežnost zdravja črevesja.
