A bélflóra széles körben használt köznyelvi kifejezés az emésztőrendszerben élő mikroorganizmusok közösségére. A tudományos szakirodalomban a preferált kifejezés a bélmikrobiota. Az egészséges bélflórát magas diverzitás, a hasznos fajok túlsúlya és a zavarok utáni regenerálódási képesség jellemzi. A bélflórát az étrend, a születés módja, az antibiotikum-előzmények, az életkor és az életmód alakítja.