A bélrendszer az agyi vegyületek figyelemre méltó sokaságát termeli. A szervezet szerotoninjának több mint 90%-a a bélben képződik, jelentős mennyiségű GABA, dopamin-prekurzor és egyéb neuroaktív vegyület mellett. Ezek közvetlenül a bélbaktériumok aktivitására válaszul szintetizálódnak – ami azt jelenti, hogy a mikrobiom összetétele alakítja a hangulatot, a szorongás szintjét, a stresszel szembeni ellenálló képességet és az alvás minőségét. Ezért irányulnak a bélrendszer egészségét célzó beavatkozások egyre inkább a mentális jóllétre.