A hisztaminintolerancia olyan állapot, amelyben a szervezet nem képes elég gyorsan lebontani a hisztamint – vagy azért, mert a DAO-enzim hiányos, vagy mert a bélbaktériumok túl sok hisztamint termelnek, vagy mindkettő miatt. Tünetei közé tartozik a fejfájás, a bőrkivörösödés és csalánkiütés, az emésztési görcsök és puffadás, a hasmenés, az orrdugulás és a kiváltó ételek elfogyasztása utáni fáradtság. A hisztaminintoleranciát gyakran tévesen IBS-nek vagy allergiának diagnosztizálják. A bélmikrobiom egyensúlyának helyreállítása célzott probiotikumokkal a legközvetlenebb mikrobiom-alapú beavatkozás.