Az emberi mikrobiom a mikroorganizmusok – baktériumok, vírusok, gombák és archeák – teljes együttese, amelyek az emberi testben és a test felszínén élnek. A bél a legnagyobb és legtöbbet vizsgált helyszín, de a test minden felülete saját mikrobiális ökoszisztémának ad otthont. Ezek a közösségek együttesen becslések szerint 3 millió egyedi gént tartalmaznak – nagyjából 150-szer több genetikai információt, mint az emberi genom –, és több ezer olyan anyagcsere-funkciót látnak el, amelyeket az emberi szervezet önmagában nem képes.
