Az IBD egy gyűjtőfogalom az emésztőrendszer krónikus gyulladásos állapotaira, beleértve a Crohn-betegséget és a fekélyes vastagbélgyulladást. Az IBS-szel ellentétben, amely funkcionális, az IBD mérhető szerkezeti gyulladással és szövetkárosodással jár. A tünetek közé tartozik a súlyos hasi fájdalom, a véres hasmenés, a fáradtság, a fogyás és a láz. Az IBD-t autoimmun-mikrobiom betegségnek tekintik: a genetikai hajlam és a bélmikrobiom-diszbiózis együttesen téves immunválaszt vált ki a bélnyálkahártya ellen.
