A szájüregi mikrobiom – a szájüreg mintegy 700 baktériumfajt tartalmaz – a bélmikrobiom kapuja. A szájüregi baktériumok minden nyeléssel az emésztőrendszerbe jutnak, ahol befolyásolhatják a bélbaktériumok összetételét. A szájüregi mikrobiom egyensúlyzavarát nemcsak a fogbetegségekkel, hanem szív- és érrendszeri betegségekkel, cukorbetegséggel, Alzheimer-kórral és IBD-vel is összefüggésbe hozták. A jó szájhigiénia a bélrendszer egészségének megőrzésében alulértékelt szerepet játszik.