Refluks kwaśny to najczęściej wyszukiwana w Google dolegliwość trawienna na świecie. Pojawia się, gdy kwas żołądkowy cofa się do przełyku, wywołując zgagę, uczucie pieczenia w klatce piersiowej lub kwaśny posmak. Częsty refluks kwaśny diagnozowany jest jako GERD (choroba refluksowa przełyku). Zaburzony mikrobiom jelitowy może nasilać objawy, zakłócając pracę dolnego zwieracza przełyku i zwiększając stan zapalny jelit. Interwencje probiotyczne są coraz częściej badane jako uzupełniające podejście do postępowania w GERD.