CFU to standardowa jednostka liczenia żywych bakterii w probiotyku. Jeden CFU odpowiada jednej bakterii zdolnej do namnażania się. Wysokiej jakości probiotyki zawierają zwykle od 1 do 50 miliardów CFU. Same liczby nie decydują jednak o skuteczności: konkretny szczep, jego przeżywalność w kwasie żołądkowym, sposób dostarczenia oraz to, czy ma dowody kliniczne dla danego problemu zdrowotnego, mają znacznie większe znaczenie.