Flora jelitowa to powszechnie używane potoczne określenie społeczności mikroorganizmów żyjących w układzie pokarmowym. W literaturze naukowej preferowanym terminem jest mikrobiota jelitowa. Zdrowa flora jelitowa charakteryzuje się wysoką różnorodnością, dominacją korzystnych gatunków oraz zdolnością do regeneracji po zaburzeniach. Florę jelitową kształtują dieta, sposób porodu, historia stosowania antybiotyków, wiek i styl życia.
