Nietolerancja histaminy to stan, w którym organizm nie potrafi rozkładać histaminy wystarczająco szybko — z powodu niedoboru enzymu DAO, nadmiernej produkcji histaminy przez bakterie jelitowe lub obu tych przyczyn. Do objawów należą bóle głowy, zaczerwienienie skóry i pokrzywka, skurcze i wzdęcia, biegunka, niedrożność nosa oraz zmęczenie po spożyciu produktów wyzwalających. Nietolerancja histaminy bywa często mylnie diagnozowana jako IBS lub alergie. Przywrócenie równowagi mikrobiomu jelitowego za pomocą ukierunkowanych probiotyków to najbardziej bezpośrednia interwencja oparta na mikrobiomie.
