Różnorodność mikrobiomu — obecność wielu różnych gatunków bakterii — to złoty standard zdrowia jelit. Można to porównać do lasu deszczowego kontra monokultura: las deszczowy jest odporny i samoregulujący się. Niska różnorodność mikrobiologiczna jest bezpośrednio powiązana z IBS, otyłością, cukrzycą typu 2, alergiami, chorobami autoimmunologicznymi i depresją. Spożywanie 30 lub więcej różnych pokarmów roślinnych tygodniowo to jedna z najlepiej udokumentowanych strategii poprawy różnorodności mikrobiomu.