Błona śluzowa to ochronna warstwa śluzu wyścielająca jelita — pierwsza linia obrony jelit. Wytwarzana przez komórki kubkowe warstwa ta stanowi siedlisko wyspecjalizowanej społeczności drobnoustrojów i pełni rolę interfejsu komunikacyjnego między bakteriami jelitowymi a komórkami odpornościowymi. Grubość błony śluzowej zależy od zdrowego mikrobiomu: bakterie takie jak Akkermansia muciniphila stymulują produkcję śluzu, podczas gdy dysbioza i przewlekły stan zapalny ścieńczają tę warstwę i zwiększają podatność na infekcje oraz nieszczelne jelito.
