Kwasy tłuszczowe omega-3 (EPA i DHA) mają bezpośredni, dobrze zbadany związek z mikrobiomem jelitowym. Zwiększają różnorodność mikrobiologiczną, wspierają wzrost korzystnych bakterii, w tym Bifidobacterium i Lactobacillus, ograniczają stan zapalny jelit i wzmacniają barierę jelitową. Omega-3 poprawiają również kolonizację probiotyczną — pomagając korzystnym bakteriom skuteczniej zasiedlać jelita. Dlatego formuły beie. zawierają omega-3 obok szczepów probiotycznych.