W przeciwieństwie do jelit, gdzie różnorodność jest pożądana, mikrobiom pochwy jest najzdrowszy, gdy dominuje w nim jeden rodzaj: Lactobacillus. Ta dominacja tworzy kwaśne środowisko pochwy, które chroni przed bakteryjnym zapaleniem pochwy, infekcjami drożdżakowymi, infekcjami przenoszonymi drogą płciową oraz powikłaniami ciąży, w tym porodem przedwczesnym. Wspieranie populacji pochwowych Lactobacillus za pomocą ukierunkowanych doustnych probiotyków to oparta na dowodach strategia o mocnym poparciu klinicznym.
